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PIM-Align: A Processing-in-Memory Architecture for FM-Index Search Algorithm
期刊论文
JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2021, 卷号: 36, 期号: 1, 页码: 56-70
作者:
Li, Xue-Qi
;
Tan, Guang-Ming
;
Sun, Ning-Hui
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浏览/下载：16/0
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提交时间：2021/12/01
accelerator design
genomic sequence alignment
near-memory computing
Pooled analysis of WHO Surgical Safety Checklist use and mortality after emergency laparotomy
期刊论文
BRITISH JOURNAL OF SURGERY, 2019, 卷号: 106, 期号: 2
作者:
Thomas, Hannah S.
;
Weiser, Thomas G.
;
Drake, Thomas M.
;
Knight, Stephen R.
;
Fairfield, Cameron
收藏
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浏览/下载：138/0
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提交时间：2019/12/05
A local alignment approach to similarity analysis of industrial alarm flood sequences
期刊论文
CONTROL ENGINEERING PRACTICE, 2016
Hu, Wenkai
;
Wang, Jiandong
;
Chen, Tongwen
收藏
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浏览/下载：3/0
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提交时间：2017/12/03
Industrial alarm systems
Alarm floods
Alarm priority
Local sequence alignment
ONLINE METHOD
BLAST
TOOL
Parallel algorithms for large-scale biological sequence alignment on Xeon-Phi based clusters
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2016, 卷号: 17
作者:
Lan, Haidong
;
Chan, Yuandong
;
Xu, Kai
;
Schmidt, Bertil
;
Peng, Shaoliang
收藏
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浏览/下载：3/0
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提交时间：2019/12/17
Smith-Waterman
Dynamic programming
Pairwise sequence alignment
Multiple sequence alignment
Xeon Phi clusters
Accelerating large-scale biological database search on Xeon Phi-based neo-heterogeneous architectures
期刊论文
Proceedings - 2015 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, BIBM 2015, 2015, 页码: 503-510
作者:
Lan, Haidong
;
Liu, Weiguo
;
Schmidt, Bertil
;
Wang, Bingqiang
收藏
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浏览/下载：4/0
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提交时间：2019/12/17
dynamic programming
Knights Corner vector instructions
neo-heterogeneous architecture
sequence alignment
Smith-Waterman
Xeon Phi
Accelerating Large-Scale Biological Database Search on Xeon Phi-based Neo-Heterogeneous Architectures
会议论文
IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, NOV 09-12, 2015
作者:
Lan, Haidong
;
Liu, Weiguo
;
Schmidt, Bertil
;
Wang, Bingqiang
收藏
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浏览/下载：2/0
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提交时间：2019/12/31
Smith-Waterman
neo-heterogeneous architecture
dynamic programming
sequence alignment
Xeon Phi
Knights Corner vector instructions
Two-level parallel alignment based on sequence parallel vectorization
其他
2014-01-01
Ji, Guo Li
;
Chen, Long Teng
;
Chen, Liang Liang
;
吉国力
收藏
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浏览/下载：3/0
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提交时间：2015/07/22
Cell membranes
T-cells
Grassmann manifold based shape matching and retrieval under partial occlusions
会议论文
International Symposium on Optoelectronic Technology and Application 2014, Beijing, China, May 13-15, 2014
作者:
Li CX(李晨曦)
;
Shi ZL(史泽林)
;
Liu YP(刘云鹏)
;
Xu BS(徐保树)
收藏
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浏览/下载：20/0
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提交时间：2014/12/29
Grassmann manifold
Partial shape matching
contour matching
partial occlusion
affine invariant
XSW: Accelerating Biological Database Search on Xeon Phi
会议论文
28th IEEE International Parallel & Distributed Processing Symposium Workshops (IPDPSW), MAY 19-23, 2014
作者:
Wang, Lipeng
;
Chan, Yuandong
;
Duan, Xiaohui
;
Lan, Haidong
;
Meng, Xiangxu
收藏
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浏览/下载：12/0
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提交时间：2019/12/31
Smith-Waterman
dynamic programming
sequence alignment
Xeon Phi
Knights Corner instructions
基于CUDA的高通量并行序列比对方法研究
学位论文
2013, 2013
李强
收藏
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浏览/下载：2/0
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提交时间：2016/01/13
CUDA
序列比对
并行计算
high-throughput data
sequence alignment
parallel computing
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