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Significantly Improved Protein Folding Thermodynamics Using a Dispersion-Corrected Water Model and a New Residue-Specific Force Field
期刊论文
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY LETTERS, 2017
Wu, Hao-Nan
;
Jiang, Fan
;
Wu, Yun-Dong
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提交时间:2017/12/03
MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS
INTRINSICALLY DISORDERED PROTEINS
ALPHA-HELIX FORMATION
SIDE-CHAIN
BACKBONE PARAMETERS
AMBER FF99SB
PEPTIDES
COOPERATIVITY
ACCURACY
EXCHANGE
Accurate Structure Prediction and Conformational Analysis of Cyclic Peptides with Residue-Specific Force Fields
期刊论文
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY LETTERS, 2016
Geng, Hao
;
Pang, Fan
;
Wu, Yun-Dong
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浏览/下载:3/0
  |  
提交时间:2017/12/03
EXCHANGE MOLECULAR-DYNAMICS
SMALL PROTEINS
AMBER FF99SB
MODELS
CYCLOPEPTIDES
OPTIMIZATION
TEMPLATES
SEARCH
DESIGN
MOTIFS
Residue-Specific Force Field Based on Protein Coil Library. RSFF2: Modification of AMBER ff99SB
期刊论文
journal of physical chemistry b, 2015
Zhou, Chen-Yang
;
Jiang, Fan
;
Wu, Yun-Dong
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提交时间:2015/11/10
MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS
BETA-HAIRPIN FORMATION
PARTICLE MESH EWALD
FOLDING SIMULATIONS
AMINO-ACIDS
SIDE-CHAIN
ALANINE RESIDUES
UNFOLDED STATE
HELIX
PEPTIDES
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