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物理研究所 [8]
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Dynamics of DNA polymerase I (Klenow fragment) under external force
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR MODELING, 2013, 卷号: 19, 期号: 3, 页码: 1379
Xie, P
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浏览/下载:19/0
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提交时间:2014/01/16
DNA replication
Chemomechanical coupling
Dynamics
Modeling translocation dynamics of strand displacement DNA synthesis by DNA polymerase I
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR MODELING, 2012, 卷号: 18, 期号: 5, 页码: 1951
Xie, P
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浏览/下载:19/0
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提交时间:2013/09/18
CRYSTAL-STRUCTURE
KLENOW FRAGMENT
TEMPERATURE-DEPENDENCE
REPLICATION COMPLEX
EXONUCLEASE SITES
STRUCTURAL BASIS
SINGLE-MOLECULE
RNA-POLYMERASE
MECHANISM
TRANSCRIPTION
A dynamic model for processive transcription elongation and backtracking long pauses by multisubunit RNA polymerases
期刊论文
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 2012, 卷号: 80, 期号: 8, 页码: 2020
Xie, P
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浏览/下载:16/0
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提交时间:2013/09/17
3.3 ANGSTROM RESOLUTION
I KLENOW FRAGMENT
STRUCTURAL BASIS
DNA-POLYMERASE
ESCHERICHIA-COLI
TEMPERATURE-DEPENDENCE
EXONUCLEASE SITES
CRYSTAL-STRUCTURE
SINGLE-MOLECULE
ACTIVE-CENTER
A model for transition of 5 '-nuclease domain of dna polymerase i from inert to active modes
期刊论文
Plos one, 2011, 卷号: 6, 期号: 1, 页码: 9
作者:
Xie, Ping
;
Sayers, Jon R.
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浏览/下载:12/0
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提交时间:2019/05/09
A Model for Transition of 5 '-Nuclease Domain of DNA Polymerase I from Inert to Active Modes
期刊论文
PLOS ONE, 2011, 卷号: 6, 期号: 1
Xie, P
;
Sayers, JR
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浏览/下载:16/0
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提交时间:2013/09/17
OLIGONUCLEOTIDE-DIRECTED MUTAGENESIS
SINGLE-STRANDED-DNA
ESCHERICHIA-COLI
EXONUCLEASE ACTIVITY
CRYSTAL-STRUCTURE
KLENOW FRAGMENT
NUCLEASE DOMAIN
ENDONUCLEASE
REPLICATION
MECHANISM
A nucleotide binding rectification Brownian ratchet model for translocation of Y-family DNA polymerases
期刊论文
THEORETICAL BIOLOGY AND MEDICAL MODELLING, 2011, 卷号: 8
Xie, P
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浏览/下载:11/0
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提交时间:2013/09/17
SYN THYMINE DIMER
I KLENOW FRAGMENT
SULFOLOBUS-SOLFATARICUS
ERROR-PRONE
LESION-BYPASS
CRYSTAL-STRUCTURE
TRANSLESION REPLICATION
CONFORMATIONAL-CHANGES
REVERSE-TRANSCRIPTASE
STRUCTURAL INSIGHTS
A possible mechanism for the dynamics of transition between polymerase and exonuclease sites in a high-fidelity DNA polymerase
期刊论文
JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY, 2009, 卷号: 259, 期号: 3, 页码: 434
Xie, P
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浏览/下载:18/0
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提交时间:2013/09/17
SINGLE-STRANDED-DNA
I KLENOW FRAGMENT
CONFERS PROCESSIVITY
CRYSTAL-STRUCTURES
MOLECULAR MOTORS
REPLICATION
TEMPLATE
COMPLEXES
TENSION
BINDING
Molecular motors that digest their track to rectify Brownian motion: processive movement of exonuclease enzymes
期刊论文
JOURNAL OF PHYSICS-CONDENSED MATTER, 2009, 卷号: 21, 期号: 37
Xie, P
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浏览/下载:14/0
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提交时间:2013/09/18
SINGLE-STRANDED-DNA
LAMBDA-EXONUCLEASE
ESCHERICHIA-COLI
KINESIN MOTORS
BACTERIOPHAGE-LAMBDA
RECJ EXONUCLEASE
BINDING-PROTEIN
RNA-POLYMERASE
MODEL
REPAIR
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