羊草种子萌发相关基因的筛选及表达分析

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	羊草种子萌发相关基因的筛选及表达分析
	刘书 ; 刘盼盼 ; 杨伟光 ; 齐冬梅 ; 李晓霞 ; 刘公社
刊名	草业学报
	2018
卷号	27 期号:11 页码:58-66
关键词	羊草种子萌发变温基因表达
ISSN号	1004-5759
英文摘要	前期实验表明,变温处理(28℃12h/16℃12h)可显著提高羊草种子的萌发率,且羊草种子萌发中的第1天是接受变温信号的关键时期。以此为研究基础,结合羊草种子变温萌发的转录组测序数据,针对羊草种子萌发初期对变温处理的响应筛选出与种子萌发、休眠及低温相关的基因24个,利用测序结果中这些基因的RPKM值制作基因表达热图并分析其表达差异。以萌发率高、低的两种羊草种质的种子为材料,对24个基因在恒温12h(28℃)和变温1d(28℃12h/16℃12h)萌发处理中的表达分别进行了定量分析。结果表明,与恒温对照相比,变温处理12h后,表达明显上调的基因有SAIN1,PP2C62,EXPB3,EXPB4,GA3ox,EXPA2和EXPA7,而表达明显下调的基因有bHLH49,GID1,ABI8,Chi1,11833,CBF3,NAC2,PP2C72,SAIN2和5423。通过进一步分析相关基因在高、低萌发率两个种质中表达的差异,筛选出其中可能与羊草种子萌发相关的基因有几丁质酶基因Chi1,转录因子基因CBF3,羊草新基因5423,赤霉素合成基因GA3ox,细胞松弛素蛋白基因EXPB4和羊草新基因SAIN1,将为下一步阐明羊草种子萌发的分子作用机理奠定基础。
语种	中文
资助机构	牧草种质资源保护项目(2130135) ; 973项目(2014CB138704)资助
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.ibcas.ac.cn/handle/2S10CLM1/23140]
专题	中科院北方资源植物重点实验室
作者单位	1.黑龙江省畜牧研究所 2.中国科学院植物研究所 3.中国科学院大学
推荐引用方式 GB/T 7714	刘书,刘盼盼,杨伟光,等. 羊草种子萌发相关基因的筛选及表达分析[J]. 草业学报,2018,27(11):58-66.
APA	刘书,刘盼盼,杨伟光,齐冬梅,李晓霞,&刘公社.(2018).羊草种子萌发相关基因的筛选及表达分析.草业学报,27(11),58-66.
MLA	刘书,et al."羊草种子萌发相关基因的筛选及表达分析".草业学报 27.11(2018):58-66.