雨生红球藻铁型超氧化物酶基因的克隆与序列分析

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	雨生红球藻铁型超氧化物酶基因的克隆与序列分析
	樊寅卯 ; 张蕾 ; 秦松 ; 严小军
刊名	海洋科学
	2012-04-15
卷号	36 期号:4 页码:79-85
关键词	雨生红球藻(Haematococcus pluvialis) 超氧化物歧化酶基因克隆序列分析
ISSN号	1000-3096
其他题名	Cloning and sequence analysis of a iron superoxide dismutase from Haematococcus pluvialis
通讯作者	严小军 xiaojunyan@hotmail.com
产权排序	宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室;中国科学院烟台海岸带可持续发展研究所;中国科学院研究生院;
中文摘要	利用已报道的FeSOD保守区域;设计简并引物;通过简并PCR的方法获得了雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)FeSOD(HpFeSOD)cDNA的部分序列;然后采用RACE方法分别克隆到5′端和3′端。拼接后得到HpFeSOD cDNA全长;该基因全长为1 138 bp;ORF为684 bp;编码227个氨基酸。把已经得到的HpFeSOD序列推导成氨基酸序列与一些已知物种的FeSOD氨基酸序列相比较;雨生红球藻FeSOD与杜氏藻、衣藻、团藻、石莼、颤藻的同源性为89%、83%、78%、70%和63%。分子系统学分析表明;雨生红球藻FeSOD与杜氏藻FeSOD聚在一起;介于真菌与高等植物之间并且真核微藻FeSOD与高等植物的同源性更高;推测其在进化上与高等植物的亲源关系更近。
英文摘要	A pair of degenerate primers was designed to amplify specific DNA fragment of FeSOD using cDNA of Haematococcus pluvialis from the homologous sequences.The middle interesting cDNA fragment was obtained by RT-PCR.The full length of HPFeSOD cDNA was obtained by 5′RACE and 3′RACE.The clone contains 1138 bp nucleotides with an open reading frame(ORF) of 684 bp comprising 227 amino acid residues.The sequence shares a high homologue with the following FeSOD: Dunaliella salina,89%,Chlamydomonas reinhardtii,83%,Volvox carteri f.nagariensis,78%,Ulva fasciata,70%,and Cyanobium sp.PCC 7001,63%.Phylogenetic analysis shows that the FeSOD from H.pluvialis and D.salina are clustered together with genes between fungi and higherplants.The FeSOD of eukaryotic microalgae and higher plants may arise through gene duplication events independently from acommon ancestor.
学科主题	分子生物学
收录类别	CSCD
资助信息	山东省杰出青年学者基金项目(JQ200914);国家自然科学基金项目(31000037);中国科学院知识创新工程计划项目(KSCX2-YW-G-073,KZCX2-YW-216,KZCX2-YW-209)
语种	中文
CSCD记录号	CSCD:4568167
公开日期	2013-03-08
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.yic.ac.cn/handle/133337/5753]
专题	烟台海岸带研究所_海岸带生物学与生物资源利用所重点实验室
推荐引用方式 GB/T 7714	樊寅卯,张蕾,秦松,等. 雨生红球藻铁型超氧化物酶基因的克隆与序列分析[J]. 海洋科学,2012,36(4):79-85.
APA	樊寅卯,张蕾,秦松,&严小军.(2012).雨生红球藻铁型超氧化物酶基因的克隆与序列分析.海洋科学,36(4),79-85.
MLA	樊寅卯,et al."雨生红球藻铁型超氧化物酶基因的克隆与序列分析".海洋科学 36.4(2012):79-85.