题名苯并[a]芘-DNA 加合物立体异构体荧光探针的合成、表征和应用
作者王超
学位类别硕士
答辩日期2009-05-01
授予单位中国科学院研究生院
授予地点北京
导师汪海林
关键词苯并[a]芘 DNA 加合物 立体异构 毛细管电泳 免疫方法 Benzo[a]pyrene DNA adduct Stereochemistry Capillary electrophoresis Immunoassay
其他题名Synthesis, Characterization and Application of DNA Fluorescent Probes Containing a Single Site-Specific Stereoisomer of anti-Benzo[a]pyrene Diol Epoxide-N2-dG
学位专业环境科学
中文摘要苯并[a]芘-DNA 加合物是多环芳烃分子毒理学研究中常用的模型探针,可以 用于发展苯并[a]芘-DNA 加合物的检测方法,研究DNA 复制、转录、重组、修 复等重要分子生物学过程中DNA-蛋白质的相互作用。本论文成功地合成和表征 定点修饰的立体异构苯并[a]芘-DNA 加合物荧光探针,并研究了单克隆抗体和苯 并[a]芘-DNA 加合物的亲和作用以及立体选择性。此外还尝试利用合成的加合物 荧光探针,发展了基因组DNA 中苯并[a]芘-DNA 加合物的竞争免疫分析方法及 人血清中特异性抗体的直接免疫分析方法。本论文的主要内容简略介绍如下: 第一章 综述了定点修饰DNA 加合物(包括苯并[a]芘-DNA 加合物)的合 成、纯化表征和应用,以及DNA 加合物检测技术(包括毛细管电泳激光诱导荧 光分析方法)。 第二章 合成并系统表征了在特定位置上共价结合一个立体异构邻二醇环 氧苯并[a]芘(BPDE)的DNA 荧光探针。首先合成了含一个trans-(+)-或者 trans-(−)-anti-BPDE-N2-鸟嘌呤的16mer 寡核苷酸(BPDE-16mer),并通过HPLC、 UV、MS、酶解反应结合HPLC 分析确认所含加合物的存在及立体构型。然后将 立体异构BPDE-16mer 和其他几条寡核苷酸连接,经聚丙烯酰胺凝胶电泳纯化, 最后得到两种单链和两种双链TMR-BPDE-90mer 探针。这四种探针均包含一个 已知立体构象BPDE 加合物和一个荧光标记。通过研究BPDE-16mer 连接到正常 寡核苷酸上的效率,发现经过anti-BPDE 修饰的16mer 会显著降低双链 BPDE-90mer 的合成效率,并产生缺口型90mer 副产物。利用特异性结合BPDE 加合物的抗体与亲和毛细管电泳分析技术(CE),进一步表征了这四种 BPDE-90mer 荧光探针,证明了单个BPDE 加合物的存在。 第三章 细致研究了BPDE 加合物的单克隆抗体mAb 8E11 与不同 BPDE-DNA 加合物的亲和作用及其立体选择性。首先,通过直接CE 免疫分析测 定mAb 8E11 与两种加合物异构体(trans-(+)- 和trans-(−)- anti-BPDE-90mer)的 亲和力,发现trans-(+) 的结合常数要略大于trans-(−),分别为6.36±0.54×108 M-1 和4.52±0.52×108 M-1。针对竞争性免疫分析,推导出定量分析亲和作用的竞争方 程。利用推导的方程与竞争性CE 免疫分析,确定四种BPDE-dG 立体异构体和mAb 8E11 的亲和力,结合常数依次为3.57±0.22×108 M-1 (trans-(+)-BPDE-dG)、 1.77±0.06×108 M-1 (cis-(+)-BPDE-dG)、1.07±0.03×108 M-1 (trans-(−)-BPDE-dG)和 1.14±0.06×107 M-1 (cis-(−)-BPDE-dG)。采用类似的方法,利用含已知含量BPDE 加合物的基因组DNA,测定了基因组DNA 中BPDE 加合物和mAb 8E11 的亲和 力。结果表明mAb 8E11 仍可以有效结合基因组中的BPDE 加合物(Kb,3.74×108 M-1),但与短链90mer DNA 相比,亲和力有所降低(下降了39.5%)。 第四章 利用合成的加合物荧光探针,尝试检测了基因组DNA 中的BPDE 加合物和癌症病人血清中的特异性抗体。首先推导了定量分析方程,并应用于竞 争性免疫中BPDE 基因组DNA 加合物的检测。另外在血清BPDE 特异性抗体检 测中,发现加合物荧光探针中所含的荧光染料TMR 和DNA 可与血清中的组分 发生一定程度的非特异性作用。通过比较损伤和未损伤探针与血清形成复合物的 不同,可以初步判断血清中是否含有可与BPDE 作用的亲和成分。
语种中文
学科主题环境化学
公开日期2010-06-07
内容类型学位论文
源URL[http://ir.rcees.ac.cn/handle/311016/346]  
专题生态环境研究中心_环境化学与生态毒理学国家重点实验室
推荐引用方式
GB/T 7714
王超. 苯并[a]芘-DNA 加合物立体异构体荧光探针的合成、表征和应用[D]. 北京. 中国科学院研究生院. 2009.
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