海洋弧菌(Vibrio sp.QD-5)褐藻胶裂解酶基因的克隆和生物信息学分析

	海洋弧菌(Vibrio sp.QD-5)褐藻胶裂解酶基因的克隆和生物信息学分析
	晁雅熙 1; 王淑艳 1; 吴谡琦 1; 陈颢 1
刊名	海洋科学进展
	2018
卷号	36 期号:2 页码:290-300
关键词	Vibrio sp. 褐藻胶裂解酶基因克隆生物信息学分析 Vibrio sp. alginate lyase gene cloning bioinformatics analysis
ISSN号	1671-6647
英文摘要	以海洋弧菌(Vibrio sp.QD-5)的基因组为模板,使用设计的褐藻胶裂解酶引物进行PCR扩增。将目的基因克隆至pet-22 b(+)载体后进行测序。测序结果显示,基因aly-II的大小为2 170 bp,预测编码含有723个氨基酸的蛋白质。对该蛋白质进一步进行了生物信息学分析。利用ProtParam和ProtScale对蛋白质的理化性质进行分析,结果表明,蛋白质Aly-II的理论分子质量为85.6 kDa,理论等电点为5.1,并且是一种亲水性蛋白。利用软件MEG 6.0对蛋白质Aly-II进行系统发育分析,结果显示,蛋白质Aly-II很可能是PL-17家族的褐藻胶裂解酶。利用同源建模法构建蛋白质Aly-II的三维结构,Aly-II含有2个结构域,分别为(alpha/alpha)6 toroid结构域和beta-sheet结构域。
资助项目	国家重点基础研究计划 ; 海洋公益性行业科研专业
WOS研究方向	Microbiology
语种	中文
CSCD记录号	CSCD:6383606
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.fio.com.cn:8080/handle/2SI8HI0U/29290]
专题	自然资源部第一海洋研究所
作者单位	1.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国 2.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国 3.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国 4.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国
推荐引用方式 GB/T 7714	晁雅熙,王淑艳,吴谡琦,等. 海洋弧菌(Vibrio sp.QD-5)褐藻胶裂解酶基因的克隆和生物信息学分析[J]. 海洋科学进展,2018,36(2):290-300.
APA	晁雅熙,王淑艳,吴谡琦,&陈颢.(2018).海洋弧菌(Vibrio sp.QD-5)褐藻胶裂解酶基因的克隆和生物信息学分析.海洋科学进展,36(2),290-300.
MLA	晁雅熙,et al."海洋弧菌(Vibrio sp.QD-5)褐藻胶裂解酶基因的克隆和生物信息学分析".海洋科学进展 36.2(2018):290-300.