基于线粒体COI基因的泰国近海有毒水母遗传多样性研究

	基于线粒体COI基因的泰国近海有毒水母遗传多样性研究
	缪晓翔 1; 肖洁 1; 张学雷 1; 刘瑞娟 1
刊名	海洋科学进展
	2017
卷号	35 期号:4 页码:535-546
关键词	立方水母钵水母 DNA条形码 COI序列泰国 Cubozoa Scyphozoa DNA barcoding COI sequences Thailand
ISSN号	1671-6647
英文摘要	利用编码线粒体细胞色素氧化酶I(COI)的基因片段序列,对泰国近海有毒水母69个样本进行遗传多样性研究,并探讨该片段作为DNA条形码对泰国近海有毒水母类进行快速分类鉴定的可行性,以期为后续有毒水母的监测和预警、生物学和生态学等的研究提供技术支撑。基因碱基组成分析表明,立方水母COI序列GC含量为42.1%,明显高于钵水母(37.1%)和水螅水母(36.9%)。COI基因编码氨基酸的密码子第3位点GC含量(30.2%)显著低于第1,2位点(分别为47.4%,42.1%),且该位点碱基替换频率最高,转换/颠换比值为1.0,表明该位点碱基突变趋于饱和;但去除密码子第3位点,对系统进化树的构建无显著影响。根据COI序列计算3个纲水母的K2P(Kimura 2-parameter)遗传距离,得出种内遗传差异为0.000~0.151,均值为0.036,同纲种间遗传差异为0.167~0.321,均值为0.263,纲间遗传差异为0.246~0.385,均值为0.334。该COI基因片段能够快速有效区分这些有毒水母种类。研究表明,泰国沿岸水母多样性较高,所获69个样品可以分为13个种,包括5种钵水母、6种立方水母和2种水螅水母,其中Carukiidae科存在新属新种。立方水母的地理分布具有明显的区域特征,马来半岛东西两岸存在物种和遗传多样性差异,其产生原因还有待于进一步研究。
资助项目	中国-东盟海上合作基金项目 ; 国家自然科学青年基金项目
WOS研究方向	Genetics & Heredity
语种	中文
CSCD记录号	CSCD:6195197
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.fio.com.cn:8080/handle/2SI8HI0U/28836]
专题	自然资源部第一海洋研究所
作者单位	1.国家海洋局第一海洋研究所, 海洋生态环境科学与工程国家海洋局重点实验室, 青岛, 山东 266061, 中国 2.国家海洋局第一海洋研究所, 海洋生态环境科学与工程国家海洋局重点实验室, 青岛, 山东 266061, 中国 3.国家海洋局第一海洋研究所, 海洋生态环境科学与工程国家海洋局重点实验室, 青岛, 山东 266061, 中国 4.国家海洋局第一海洋研究所, 海洋生态环境科学与工程国家海洋局重点实验室, 青岛, 山东 266061, 中国
推荐引用方式 GB/T 7714	缪晓翔,肖洁,张学雷,等. 基于线粒体COI基因的泰国近海有毒水母遗传多样性研究[J]. 海洋科学进展,2017,35(4):535-546.
APA	缪晓翔,肖洁,张学雷,&刘瑞娟.(2017).基于线粒体COI基因的泰国近海有毒水母遗传多样性研究.海洋科学进展,35(4),535-546.
MLA	缪晓翔,et al."基于线粒体COI基因的泰国近海有毒水母遗传多样性研究".海洋科学进展 35.4(2017):535-546.