2个银叶真藓HSP70序列的生物信息学相关分析/Bioinformatics relevant analysis of two heat shock protein 70 sequence from Bryum argenteum[J]

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	2个银叶真藓HSP70序列的生物信息学相关分析/Bioinformatics relevant analysis of two heat shock protein 70 sequence from Bryum argenteum[J]
	王明强; 高贝; 张道远; WANG Mingqiang; GAO Bei; ZHANG Daoyuan; 中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室,中国科学院新疆生态与地理研究所,乌鲁木齐830011; 中国科学院大学,北京100049
刊名	生物信息学
	2015
卷号	1 页码:1-8
关键词	真藓热激蛋白70 Rna-seq 生物信息学 Bryum Argenteum Heat Shock Protein 70 Rna-seq Bioinformatics
英文摘要	从银叶真藓（Bryum argenteum）转录组数据库出发，使用Pfam数据库提供的HMM模型共得到33条长度大于200aa，注释的热休克蛋白BaHSP70；其中2条（BaHSP70?1， BaHSP70?2）具有完整ORF，NCBI核酸数据库登录号为KP087877和KP087878。使用生物信息学在线分析工具和软件，对真藓HSP70的两条蛋白质序列从氨基酸组成、保守结构域、理化性质、疏水性／亲水性、信号肽、蛋白质结构、模体的识别及同源性分析等方面进行了预测和分析。结果表明：2条BaHSP70s基因序列ORF全长分别为2396 bp和2356 bp，分别编码649aa和650aa。序列模体分析表明BaHSP70s和其它报道的植物HSP70均含有4个相同的模体，并且各模体在蛋白质序列上顺序一致。通过对2条BaHSP70s进行氨基酸多序列比对及基因树分析，发现BaHSP70?1和BaHSP70?2雪莲相似度最高，分别是91．2％和86．6％。本研究为进一步研究HSP70基因的克隆和功能验证奠定了基础。
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语种	中文
资助机构	NSFC-新疆青年人才联合项目( U1403302)。 ; NSFC-新疆青年人才联合项目( U1403302)。 ; NSFC-新疆青年人才联合项目( U1403302)。 ; NSFC-新疆青年人才联合项目( U1403302)。
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.xjlas.org/handle/365004/14484]
专题	新疆生态与地理研究所_研究系统_荒漠环境研究室
通讯作者	中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室,中国科学院新疆生态与地理研究所,乌鲁木齐830011; 中国科学院大学,北京100049
推荐引用方式 GB/T 7714	王明强,高贝,张道远,等. 2个银叶真藓HSP70序列的生物信息学相关分析/Bioinformatics relevant analysis of two heat shock protein 70 sequence from Bryum argenteum[J][J]. 生物信息学,2015,1:1-8.
APA	王明强.,高贝.,张道远.,WANG Mingqiang.,GAO Bei.,...&中国科学院大学,北京100049.(2015).2个银叶真藓HSP70序列的生物信息学相关分析/Bioinformatics relevant analysis of two heat shock protein 70 sequence from Bryum argenteum[J].生物信息学,1,1-8.
MLA	王明强,et al."2个银叶真藓HSP70序列的生物信息学相关分析/Bioinformatics relevant analysis of two heat shock protein 70 sequence from Bryum argenteum[J]".生物信息学 1(2015):1-8.