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白菜型油菜和菜薹的InDel标记开发及其RILs群体遗传连锁图谱的构建
孟霖; 刘博; 林良斌; 程峰; 王晓武; 武剑
刊名园艺学报
2012-08-25
期号08页码:1491-1500
关键词菜薹 油菜 白菜 插入/缺失 全基因组重测序 Illumina测序 遗传连锁图
英文摘要通过白菜型油菜‘R-O-18’和菜薹‘L58’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列(‘Chiifu-401-42’的基因组序列)的比对,在全基因组范围内检测到了18479个短插入缺失变异位点(≤5bp)。从中挑选了500个插入/缺失片段为4~5bp的InDel变异位点,将其设计成InDel分子标记并进行试验验证,结果有452个标记通过PCR扩增出单一条带,但仅有106个在‘R-O-18’和‘L58’间表现出多态性,346个没有多态性,48个在PCR中没有扩增。亲本间具有多态性的106个InDel标记可用来检测以‘R-O-18’和‘L58’为亲本构建的RILs基因型,并构建了一张包含99个标...
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语种中文
内容类型期刊论文
源URL[http://111.203.20.206/handle/2HMLN22E/99518]  
专题蔬菜花卉研究所_生物技术研究室
作者单位云南农业大学农学与生物技术学院;中国农业科学院蔬菜花卉研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
孟霖,刘博,林良斌,等. 白菜型油菜和菜薹的InDel标记开发及其RILs群体遗传连锁图谱的构建[J]. 园艺学报,2012(08):1491-1500.
APA 孟霖,刘博,林良斌,程峰,王晓武,&武剑.(2012).白菜型油菜和菜薹的InDel标记开发及其RILs群体遗传连锁图谱的构建.园艺学报(08),1491-1500.
MLA 孟霖,et al."白菜型油菜和菜薹的InDel标记开发及其RILs群体遗传连锁图谱的构建".园艺学报 .08(2012):1491-1500.
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