适用于大豆疫霉菌遗传分析的新EST-SSR标记

	适用于大豆疫霉菌遗传分析的新EST-SSR标记
	蔺宇 1; 徐静静 1; 王晓鸣 1; 武小菲 1; 李彦舫 2; 朱振东 1
刊名	中国农业科学
	2008
卷号	41 期号:8 页码:2294-2301
关键词	大豆疫霉菌表达序列标签(EST) SSR标记通用性
ISSN号	0578-1752
其他题名	Novel EST-SSR Markers for Genetic Analysis of Phytophthora sojae
英文摘要	【目的】开发大豆疫霉菌SSR标记,为深入了解大豆疫霉菌遗传变异提供理想分析工具。【方法】用SSRIT软件对28197条大豆疫霉菌EST进行SSR搜索,选择含有SSR的合适EST设计、合成引物和PCR扩增。【结果】发现1454条EST含有SSR,其中3个碱基重复基元类型最多,有855个,占鉴定总数的54.3%。设计合成140对引物,用10个大豆疫霉菌菌株基因组DNA进行PCR检测,有111对引物(79.3%)扩增出SSR特征条带。通用性检测表明有33对引物在检测的1个或多个其它疫霉菌或腐霉菌中产生扩增产物。【结论】大豆疫霉菌EST含有丰富的SSR位点,本研究从EST中开发了111个新大豆疫霉菌SSR标记,可有效地用于大豆疫霉菌及其相关种的遗传变异研究。
学科主题	农业基础科学
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/129059]
专题	作物科学研究所_种质资源保存与研究中心
作者单位	1.中国农业科学院作物科学研究所国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程, 北京, 100081; 2.吉林大学农学院, 吉林, 长春, 130062
推荐引用方式 GB/T 7714	蔺宇,徐静静,王晓鸣,等. 适用于大豆疫霉菌遗传分析的新EST-SSR标记[J]. 中国农业科学,2008,41(8):2294-2301.
APA	蔺宇,徐静静,王晓鸣,武小菲,李彦舫,&朱振东.(2008).适用于大豆疫霉菌遗传分析的新EST-SSR标记.中国农业科学,41(8),2294-2301.
MLA	蔺宇,et al."适用于大豆疫霉菌遗传分析的新EST-SSR标记".中国农业科学 41.8(2008):2294-2301.