基于生物信息学的玉米抗病QTL比较定位 | |
刘红军1; 李晓辉2; 刘晓鑫2; 李新海1 | |
刊名 | 分子植物育种 |
2010 | |
卷号 | 8期号:1页码:151-160 |
关键词 | 玉米 抗病QTL 元分析 整合图谱 比较定位 |
ISSN号 | 1672-416X |
其他题名 | Comparative Mapping of Disease Resistance QTL in Maize Based on Bioinformatics |
英文摘要 | 以玉米遗传连锁图谱IBM 22008 Neighbors为参考图谱,利用BioMercator2.1软件,通过映射来自不同实验中的340个玉米抗病QTL,构建出玉米抗病QTL的整合图谱.采用元分析技术,在1、3、6、10号染色体上发掘5个"一致性抗病QTL"区间,图距分别为5.14 cM、9.00 cM、28.50 cM、1.73 cM和33.34 cM.从MaizeGDB网站下载"一致性抗病QTL"区间内的基因和标记原始序列,采用NCBI网站在线软件BlastX通过同源比对,在5个"一致性抗病QTL"区间内初步确定8个抗病基因同源序列.借助比较基因电子定位策略,将54个水稻和44个玉米抗性基因转定于玉米IBM 2 2008 Neighbors遗传连锁图谱上.本文研究结果为玉米抗病QTL精细定位和克隆奠定了基础. |
学科主题 | 植物保护 |
语种 | 中文 |
内容类型 | 期刊论文 |
源URL | [http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/128091] |
专题 | 作物科学研究所_职能部门 |
作者单位 | 1.中国农业科学院作物科学研究所, 北京, 100081; 2.吉林省农业科学院生物技术研究中心, 吉林, 长春, 130033 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘红军,李晓辉,刘晓鑫,等. 基于生物信息学的玉米抗病QTL比较定位[J]. 分子植物育种,2010,8(1):151-160. |
APA | 刘红军,李晓辉,刘晓鑫,&李新海.(2010).基于生物信息学的玉米抗病QTL比较定位.分子植物育种,8(1),151-160. |
MLA | 刘红军,et al."基于生物信息学的玉米抗病QTL比较定位".分子植物育种 8.1(2010):151-160. |
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