| 大丽轮枝菌(VerticilliumdahliaeVdLs.17)分泌组预测及分析 | |
| 田李; 陈捷胤; 陈相永; 汪佳妮; 戴小枫 | |
| 刊名 | 中国农业科学
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| 2011-08-01 | |
| 期号 | 15页码:3142-3153 |
| 关键词 | 大丽轮枝菌 分泌蛋白 信号肽 碳水化合物活性酶 激发子 |
| 英文摘要 | 【目的】预测并分析大丽轮枝菌基因组范围内的分泌蛋白,为大丽轮枝菌分泌蛋白致病机理的研究奠定基础。【方法】利用已公布的大丽轮枝菌全基因组序列,组合使用生物信息学软件SignalP、TargetP、TMHMM、Big-pi和PROSITE,预测大丽轮枝菌基因组范围内所有分泌蛋白,定义为分泌组。统计分析分泌组中蛋白N-端信号肽特点;应用碳水化合物活性酶类数据库和病原菌-寄主互作蛋白数据库对分泌组蛋白进行注释,预测分泌组中潜在果胶酶、纤维素酶和病原菌寄主互作蛋白;利用真菌激发子的保守结构域,预测分泌组中潜在的激发子蛋白集;应用BLASTP程序比较分析大丽轮枝菌和黑白轮枝菌分泌组,获得大丽轮枝菌相对于黑... |
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| 语种 | 中文 |
| 内容类型 | 期刊论文 |
| 源URL | [http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/127289]  |
| 专题 | 作物科学研究所 |
| 作者单位 | 中国农业科学院作物科学研究所 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 田李,陈捷胤,陈相永,等. 大丽轮枝菌(VerticilliumdahliaeVdLs.17)分泌组预测及分析[J]. 中国农业科学,2011(15):3142-3153. |
| APA | 田李,陈捷胤,陈相永,汪佳妮,&戴小枫.(2011).大丽轮枝菌(VerticilliumdahliaeVdLs.17)分泌组预测及分析.中国农业科学(15),3142-3153. |
| MLA | 田李,et al."大丽轮枝菌(VerticilliumdahliaeVdLs.17)分泌组预测及分析".中国农业科学 .15(2011):3142-3153. |
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