玉米Gln1-4的gDNA序列、基因结构、保守功能域与等位变异

	玉米Gln1-4的gDNA序列、基因结构、保守功能域与等位变异
	吴永升; 李新海; 郝转芳; 张世煌; 谢传晓
刊名	作物学报
	2009
卷号	35 期号:6 页码:983-991
关键词	玉米 Gin1-4基因功能域自然等位变异氮利用效率
ISSN号	0496-3490
其他题名	Genomic DNA Sequence, Gene Structure, Conserved Domains, and Natural Alleles of Gln1-4 Gene in Maize
英文摘要	本研究旨在分离玉米谷氨酰胺合成酶(GS)家族重要成员Gin1-4 gDNA序列全长,分析基因结构、保守功能域与自然等位变异,为氮利用效率功能位点关联性分析奠定基础.利用PCR步移(walking)方法分离Gln1-4基因区域基因组DNA序列,用生物信息学方法分析基因结构与保守功能域,测序与序列比对法分析重要区域自然等位变异.结果表明,分离得到自交系M017 Gln1-4区域gDNA 3 724 bp,起始密码子至终止密码子序列长2 858 bp,登录到GenBank(登录号为EU369651),并注释.Gln1-4基因含10个外显子与9个内含子,18个剪接位点均为保守的5'供位GU与3'受位AG模式.编码的GS蛋白由356个氨基酸组成,分子量39.2 kD,等电点(pI)为5.202.氨基末端外显子2到外显子6为氨离子结合结构保守功能域;羧基末端外显子8与外显子9构成ATP酶活性保守功能域.Gln1-4与Gln1-3基因相比,在DNA序列、氨基酸序列、基因结构、保守功能域均很保守,氨基酸序列一致性达98.31%.52个玉米自交系的Gln1-4等位变异分析中,共鉴定出318个等位变异位点,其中242个SNP,45个Indels,占90%.该基因氮利用效率功能关联性分析区间应位于氨离子结合功能域与ATPase活性保守功能域中重要的变异位点,18个剪接位点.
学科主题	农作物
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://111.203.20.206/handle/2HMLN22E/1410]
专题	作物科学研究所_遗传育种系
作者单位	中国农业科学院作物科学研究所, 国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程, 北京, 100081
推荐引用方式 GB/T 7714	吴永升,李新海,郝转芳,等. 玉米Gln1-4的gDNA序列、基因结构、保守功能域与等位变异[J]. 作物学报,2009,35(6):983-991.
APA	吴永升,李新海,郝转芳,张世煌,&谢传晓.(2009).玉米Gln1-4的gDNA序列、基因结构、保守功能域与等位变异.作物学报,35(6),983-991.
MLA	吴永升,et al."玉米Gln1-4的gDNA序列、基因结构、保守功能域与等位变异".作物学报 35.6(2009):983-991.