基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构

	基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构
	刘志斋 1; 吴迅 1; 刘海利 1; 李永祥 1; 李清超 1; 王凤格 2; 石云素 1; 宋燕春 1; 宋伟彬 3; 赵久然 2
刊名	中国农业科学
	2012
卷号	45 期号:11 页码:2107-2138
关键词	玉米自交系遗传多样性群体结构
ISSN号	0578-1752
其他题名	Genetic Diversity and Population Structure of Important Chinese Maize Inbred Lines Revealed by 40 Core Simple Sequence Repeats (SSRs)
英文摘要	【目的】选择有代表性的材料进行遗传多样性与群体结构的解析是进行等位基因发掘、复杂性状关联分析、研究,及作物育种实践的重要基础。【方法】利用覆盖玉米全基因组的40个核心SSR标记,采用基于测序的基因型鉴定技术对820份代表中国玉米育种资源种质基础的自交系进行全基因组扫描,通过PowerMarker V3.25与Structure V2.3.3等软件揭示其基因多样性与群体结构。【结果】在820份自交系中,40个SSR标记所检测到的等位变异为10—72个,平均36.87个/位点;基因多样性为0.46—0.9458,平均0.8430;PIC为0.43—0.94,平均0.83。聚类分析表明,K=5时,△K值最大,即这些自交系可以划分成5个类群,依次为兰卡斯特、旅大红骨、塘四平头、瑞德与P群,各类群内平均等位变异与遗传多样性分别为24.23个/位点与0.8145、22个/位点与0.8398、11.8个/位点与0.7054、17.45个/位点与0.7686以及14.65个/位点与0.7495。【结论】中国玉米自交系在育种实践中形成了相对独立的优势类群,蕴含了比较丰富的遗传变异,显示出了较高水平的基因多样性。不同类群之间的遗传多样性水平存在一定的差异,在划分的5个类群中,兰卡斯特与旅大红骨类群的遗传变异相对较丰富,基因多样性相对较高,其次为瑞德与P群,塘四平头相对较低。
学科主题	农作物
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://111.203.20.206/handle/2HMLN22E/58]
专题	作物科学研究所_种质资源保存与研究中心
作者单位	1.中国农业科学院作物科学研究所, 北京, 100081 2.北京市农林科学院玉米研究中心, 北京, 100097 3.中国农业大学国家玉米改良中心, 北京, 100094
推荐引用方式 GB/T 7714	刘志斋,吴迅,刘海利,等. 基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构[J]. 中国农业科学,2012,45(11):2107-2138.
APA	刘志斋.,吴迅.,刘海利.,李永祥.,李清超.,...&王天宇.(2012).基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构.中国农业科学,45(11),2107-2138.
MLA	刘志斋,et al."基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构".中国农业科学 45.11(2012):2107-2138.