裂叶牵牛获得表达序列标签资源的简单序列重复信息分析

CORC > 中国农业科学院 > 作物科学研究所

	裂叶牵牛获得表达序列标签资源的简单序列重复信息分析
	刘越; 范增华; 孙洪波; 冯金朝; 张水仙; 熊圣文; 刘生全; 黄璐琦
刊名	中国药学杂志
	2011-12-08
期号	23 页码:1790-1794
关键词	裂叶牵牛获得表达序列标签简单序列重复分析
英文摘要	目的为了在裂叶牵牛中开发功能性EST-SSR分子标记,分析裂叶牵牛EST-SSRs特征。方法从NCBI公共数据库中下载裂叶牵牛EST序列,运用DNAstar软件中的SeqmanPro程序,对下载序列进行拼接和聚类,去除冗余序列,利用SSRIT软件筛选重复序列长度≥20bp的二、三、四、五、六、七、八核苷酸7种类型的SSR,统计分析裂叶牵牛EST-SSRs的特征。结果从NCBI公共数据库中下载62388条裂叶牵牛EST序列,剔除冗余序列,得到全长为8.35×106bp的无冗余EST序列11569条。在这些序列中搜索出985条EST序列含有1132个SSRs,占无冗余EST序列的9.7...
URL标识	查看原文
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://111.203.20.206/handle/2HMLN22E/2628]
专题	作物科学研究所
作者单位	中央民族大学生命与环境科学学院;中国中医科学院中药研究所;中国农业科学院作物科学研究所
推荐引用方式 GB/T 7714	刘越,范增华,孙洪波,等. 裂叶牵牛获得表达序列标签资源的简单序列重复信息分析[J]. 中国药学杂志,2011(23):1790-1794.
APA	刘越.,范增华.,孙洪波.,冯金朝.,张水仙.,...&黄璐琦.(2011).裂叶牵牛获得表达序列标签资源的简单序列重复信息分析.中国药学杂志(23),1790-1794.
MLA	刘越,et al."裂叶牵牛获得表达序列标签资源的简单序列重复信息分析".中国药学杂志 .23(2011):1790-1794.