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题名	真核生物基因组注解及原核生物基因组测序数据研究; Genome Annotation for Eukaryotes and Analysis of Prokaryote Genome Sequencing Data
作者	陈丽娜
答辩日期	2016-03-21 ; 2015-05-18
导师	王颖
关键词	k-tuple频度 随机模型 微生物群落 真核生物 结构注释 k-tuple frequency stochastic model microbial communities eukaryotic genomic structure annotation
英文摘要	生物按照细胞类型分类有真核生物与原核生物，本文主要从真核生物与原核生物两个角度研究生物信息领域的意义所在。 随着高通量测序技术的发展，大量物种被测序并装配获得基因组序列。然而，如何快速准确地注解真核基因组的结构仍然是一个重要问题。目前注解一个真核基因组需要大量来源可靠、不同类型的参考数据源，例如相同或近似物种的蛋白质序列、EST、cDNA序列以及RNA-Seq数据。收集大量可靠的数据，并整合不同数据的分析结果，获得一致、完整的注解结果是一项耗时复杂的工作。因此，本研究第一部分提出一种快速便捷的计算工具GASS，利用相似物种的注解信息来完成一个新物种基因组的结构注解。首先将相似物种的外显子序列...; With the development of high-throughput sequencing techniques, more and more genomes are sequenced and assembled. However, annotating a genome’s structure rapidly and expressly remains challenging. Current eukaryotic genome annotations require various, abundant supporting data, such as: species-specific and cross-species protein sequences, ESTs, cDNA and RNA-Seq data. Collecting those data and mer...; 学位：工学硕士; 院系专业：信息科学与技术学院_系统工程; 学号：23220121153057
语种	zh_CN
出处	http://210.34.4.13:8080/lunwen/detail.asp?serial=49607
内容类型	学位论文
源URL	[http://dspace.xmu.edu.cn/handle/2288/134931]
专题	信息技术－学位论文
推荐引用方式 GB/T 7714	陈丽娜. 真核生物基因组注解及原核生物基因组测序数据研究, Genome Annotation for Eukaryotes and Analysis of Prokaryote Genome Sequencing Data[D]. 2016, 2015.

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