基于多GPU的ReaxFFMD并行策略的设计和实现

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	基于多GPU的ReaxFFMD并行策略的设计和实现
	郑默; 李晓霞; 郭力
	2016
会议名称	中国化学会第30届学术年会-第二十五分会：化学信息学与化学计量学
会议日期	2016-07-01
会议地点	中国辽宁大连
关键词	反应分子动力学ReaxFF MD MPI-GMD-Reax GPU 大规模模拟
中文摘要	化学反应分子动力学ReaxFF MD~1方法可连续描述化学键的断裂和生成,且不必预先定义反应路径,成为有潜力可从分子层次认识复杂体系反应机理的新途径。针对ReaxFF MD可模拟的时空尺度受限~2,难以应用于大规模体系(>50,000原子)反应模拟的问题,本文提出了基于图形处理器GPU和MPI消息传递编程模型的ReaxFF MD并行策略,并创建了跨节点、多GPU并行加速的ReaxFF MD程序系统MPI-GMD-Reax。MPI-GMD-Reax充分利用了GPU强大的流处理器、CUDA支持大量线程级并行及MPI高效灵活的特性,进一步提升了ReaxFF MD的整体性能和运行规模。保守估计,在四节...
会议录	中国化学会第30届学术年会摘要集-第二十五分会：化学信息学与化学计量学
内容类型	会议论文
源URL	[http://ir.ipe.ac.cn/handle/122111/22173]
专题	过程工程研究所_研究所（批量导入）
作者单位	中国科学院过程工程研究所多相复杂系统国家重点实验室
推荐引用方式 GB/T 7714	郑默,李晓霞,郭力. 基于多GPU的ReaxFFMD并行策略的设计和实现[C]. 见:中国化学会第30届学术年会-第二十五分会：化学信息学与化学计量学. 中国辽宁大连. 2016-07-01.